Діагностичний напрямок
Патоморфологічна та онкологічна панель
Загальна характеристика
Колоректальна панель - це комплексне молекулярно-генетичне дослідження соматичних мутацій у пухлинній тканині, що дозволяє визначити індивідуальний біологічний профіль новоутворення. Дослідження базується на аналізі ключових ланок внутрішньоклітинної передачі сигналів: MAPK-шляху (гени RAS-BRAF) та PI3K/AKT-шляху.
Метод ПЛР у реальному часі (Real-Time PCR) забезпечує високу аналітичну чутливість (межа виявлення мутантного алеля від 1–5%), що дозволяє ефективно аналізувати біоптати з низьким вмістом пухлинних клітин. Панель включає аналіз розширеного спектра мутацій ((гени KRAS/NRAS: екзони 2, 3, 4, кодони 12, 13, 59, 61, 117, 146), детекцію мутації BRAF V600E, а також аналіз гарячих точок гена PIK3CA (екзони 9, 20), кодони 542 та 1047 відповідно та гена AKT.
Відповідно до міжнародних настанов NCCN, ESMO та ASCO, тестування на мутації KRAS, NRAS та BRAF є обов'язковим стандартом (рівень доказовості 1A) для пацієнтів із метастатичним процесом КРР. Згідно з вимогами EMA, використання анти-EGFR терапії дозволено виключно при підтвердженій відсутності мутацій (дикий тип) у всіх зазначених кодонах.
Важливо! Для забезпечення достовірності результату ПЛР-дослідження, слід використовувати гістологічно верифікований матеріал того ж зразка, що застосовувався для первинного дослідження.
Показання для призначення
Дослідження є важливим етапом діагностики для пацієнтів із верифікованим колоректальним раком, особливо при наявності метастазування.
Клінічні показання:
- статус генів КRAS/NRAS: визначення доцільності призначення моноклональних антитіл до EGFR;
- оцінка прогнозу захворювання: ідентифікація пацієнтів із несприятливим перебігом (зокрема при мутації BRAF V600E);
- виявлення механізмів резистентності: моніторинг причин неефективності поточної терапії та корекція схеми лікування;
- диференціальна діагностика: оцінка статусу BRAF для виключення синдрому Лінча при наявності мікросателітної нестабільності (MSI);
- наявність мутації PIK3CA та AKT1 E17K може знижувати ефективність анти-EGFR терапії у пацієнтів із диким типом KRAS/NRAS;
- у комбінації з іншими маркерами (KRAS, NRAS, BRAF) допомагає стратифікувати пацієнтів для персоніфікованої терапії.
Маркер
BRAF V600E, КRAS/NRAS (кодони 12, 13, 59, 61, 117, 146), PIK3CA (кодони 542 та 1047), AKT1 E17K.
Повний перелік мутацій:
KRAS 12/13 кодон: G12A, G12D, G12C, G12S, G12V, G13C, G13R, G13S, G13A, G13D, G13V; KRAS 59 кодон: A59T, A59E, A59G;
KRAS 61 кодон: Q61H (A>C), Q61H (A>T), Q61L, Q61R;
KRAS 117 кодон: K117N (A>C), K117N (A>T), K117R, K117E;
KRAS 146 кодон: A146T, A146P, A146V;
NRAS 12/13 кодон: G12D, G12S, G12C, G13R, G13V;
NRAS 59 кодон: A59T, A59D;
NRAS 61 кодон: Q61K, Q61L, Q61R, Q61H (A>C), Q61H (A>T);
NRAS 117кодон: K117R;
NRAS 146 кодон: A146T;
PIK3CA 542/545 кодон: E542K, E545K, E545Q;
PIK3CA 1047 кодон: H1047R, H1047L;
AKT1: E17K.
Клінічна значущість
Молекулярне профілювання за допомогою даної панелі дозволяє реалізувати принципи персоналізованої онкології, уникаючи призначення неефективного та потенційно токсичного лікування.
- Статус RAS (KRAS/NRAS): наявність мутацій у цих генах є абсолютним негативним предиктором відповіді на анти-EGFR терапію. Пухлина з мутацією KRAS/NRAS стає автономною, і блокування рецептора EGFR не зупиняє її ріст;
- виявлення мутації BRAF V600E свідчить про агресивний перебіг пухлини та обмежену ефективність стандартних схем лікування, що обґрунтовує застосування комбінованих терапевтичних протоколів із BRAF інгібіторами та, за потреби, іншими таргетними препаратами;
- шлях PI3K/AKT: мутації в генах PIK3CA та AKT асоційовані з розвитком резистентності до терапії та активацією альтернативних сигнальних механізмів виживання клітин.
Склад показників:
Клінічний діагноз:
Номер блоку, обраного для дослідження:
Кількість пухлинних клітин:
Відсоток пухлинних клітин:
Мутації KRAS 12/13 кодон
Мутації KRAS 59 кодон
Мутації KRAS 61 кодон
Мутації KRAS 117 кодон
Мутації KRAS 146 кодон
Мутації NRAS 12/13 кодон
Мутації NRAS 59 кодон
Мутації NRAS 61 кодон
Мутація NRAS 117 кодон
Мутація NRAS 146 кодон
Мутації BRAF V600E/E2/D/K
Мутації PIK3CA 542/545 кодон
Мутації PIK3CA 1047 кодон
Мутація AKT1 E17K
ЗАКЛЮЧЕННЯ:
Мутації, що досліджувались:
Правила підготовки
зразок тканини
Правила доставки біоматеріалів до лабораторії
зразок тканини
Біоматеріал для дослідження: Зразок тканини (ПЛР). Тип пробірки, об’єм БМ в пробірці: Парафіновий блок. Умови доставки: Температура від 9 до 25 градусів, час доставки не обмежений Коментар: доставлений парафіновий блок має знаходитись у контейнері (захищений від вологи та пошкоджень) .
