Cроки выполнения
Болезнь Крона – это хроническое рецидивирующее иммуноопосредованное воспалительное заболевание желудочно-кишечного тракта мультифакториальной природы, развивающееся вследствие взаимодействия генетической предрасположенности, факторов окружающей среды и нарушений иммунного ответа. Характеризуется сегментарным (очаговым) и трансмуральным (с привлечением всех слоев стенки) воспалением, которое может поражать любой участок пищеварительного тракта – от полости рта до анального канала.
Важную роль в предрасположенности к болезни Крона играют генетические факторы. В частности, гены NOD2 и ATG16L1 принимают участие в распознавании бактериальных компонентов, регуляции иммунного ответа и поддержании нормального функционирования клеток кишечника. Некоторые варианты этих генов ассоциированы с повышенным риском развития заболевания.
Исследование «Генетический профиль риска болезни Крона (NOD2 + ATG16L1)» позволяет выявить четыре генетических варианта, связанных с предрасположенностью к этому заболеванию. Результаты могут дополнить клиническую оценку пациента и помочь врачу лучше понять генетические факторы риска в конкретной клинической ситуации.
Гены NOD2 и ATG16L1 участвуют в механизмах врожденного иммунитета и поддержании гомеостаза кишечника. Некоторые варианты этих генов ассоциируются с повышенным риском болезни Крона, однако их наличие не означает, что заболевание обязательно разовьется.
Значения генов NOD2 и ATG16L1:
NOD2 - распознавание бактериальных компонентов
Ген NOD2 кодирует внутриклеточный рецептор, распознающий мурамилдипептид – компонент бактериальной клеточной стенки – и участвует в регуляции врожденного иммунитета.
Три изучаемых варианта NOD2 (R702W, G908R и 3020insC) в популяционных исследованиях ассоциировались с повышенной предрасположенностью к болезни Крона. Для отдельных вариантов описана связь с поражением подвздошной кишки и определенными фенотипами заболевания. Однако генетический результат не позволяет достоверно предусмотреть индивидуальное течение заболевания.
ATG16L1 - аутофагия и кишечный барьер
Ген ATG16L1 кодирует белок, необходимый для аутофагии – процесса внутриклеточного удаления и переработки поврежденных компонентов и контроля микроорганизмов.
Варианты ATG16L1, в частности, распространенный полиморфизм p.Thr300Ala (T300A; rs2241880), ассоциируются с риском развития болезни Крона. Эта ассоциация отражает генетическую предрасположенность, а не активное воспаление кишечника.
Исследование этих генов позволяет определить наличие конкретных изучаемых вариантов генетической предрасположенности. Его клиническое значение зависит от перечня вариантов, входящих в тест, семейный анамнез и клиническую ситуацию.
Генетическое исследование «Генетический профиль риска болезни Крона (NOD2 + ATG16L1)» может рассматриваться в рамках специализированной оценки генетических факторов или научно-клинических программ:
1.У пациентов с семейным анамнезом болезни Крона – для определения отдельных генетических вариантов, ассоциированных со склонностью к заболеванию. В то же время исследование не является рекомендованным рутинным скринингом бессимптомных родственников;
2. У пациентов с подтвержденной болезнью Крона – для характеристики наличия исследуемых генетических вариантов в пределах специализированной оценки или научного протокола. Результаты не используются самостоятельно для определения прогноза или выбора терапии;
3.У пациентов, участвующих в научно-клинических исследованиях - для определения четырех генетических вариантов NOD2 и ATG16L1, включенных в исследуемую панель
Обратите внимание: при подозрении на болезнь Крона генетическое исследование NOD2+ATG16L1 не должно заменять или откладывать стандартное диагностическое обследование. Оно не рекомендовано в качестве самостоятельного теста для подтверждения или исключения заболевания.
Генетическое тестирование может быть полезным как дополнительный инструмент в выбранных клинических случаях, но не заменяет стандартные методы диагностики. Исследование не является методом диагностики болезни Крона, не позволяет установить ее активность, локализацию или прогнозировать индивидуальное течение. Отсутствие изучаемых вариантов также не исключает генетическую предрасположенность или наличие заболевания.
Метод применяется для генотипирования четырех изучаемых вариантов генов, ассоциированных с риском развития болезни Крона:
• NOD2 (CARD15) - c.3019_3020insC (3020insC);
• NOD2 (CARD15) - c.2722 G>C (p.Gly908Arg);
• NOD2 (CARD15) - c.2104 C>T (p.Arg702Trp);
• ATG16L1 - c.898 A>G (p.Thr300Ala).
Исследование позволяет:
• определить четыре конкретных генетических варианта, ассоциированных со склонностью к болезни Крона;
• получить дополнительную информацию об отдельных генетических особенностях пациента;
• использовать результаты в качестве исследовательских данных при изучении генетических ассоциаций с болезнью Крона.
Генетические ассоциации не одинаково выражены в разных популяциях. Их клиническая значимость зависит от конкретного варианта его частоты в популяции и сочетания с другими генетическими и популяционными факторами.
Варианты NOD2 связаны с распознаванием бактериальных компонентов и регуляцией врожденного иммунного ответа. Вариант ATG16L1 T300A ассоциируется с изменениями функционирования аутофагии – клеточного механизма, важного для поддержания гомеостаза кишечника.
Метод: Полимеразная цепная реакция в реальном времени
венозная кровь
За 4 часа Выдержать голодание, исключить жирную пищу. Можно пить воду. Для детей до 1 года - желательно придерживаться максимально возможного промежутка между кормлениями или непосредственно перед следующим кормлением.
Для генетического исследования:
Аналитические факторы
•недостаточное количество или низкое качество выделенной ДНК может препятствовать получению достоверного результата;
•ингибиторы ПЦР, если этот метод применяется, могут подавлять амплификацию;
• контаминация посторонней ДНК может вызывать ложные или неоднозначные результаты;
Ограничение аналитического охвата:
метод выявляет только те варианты, для которых он валидирован, и не исключает других генетических факторов склонности.
Интерпретацией результата должен заниматься квалифицированный специалист, четко понимающий преимущества и ограничения теста в контексте всех клинико-анамнестических данных. Неправильное использование теста может увеличить вероятность постановки ошибочного диагноза и привести к ненужным вмешательствам и снижению качества жизни пациента.
Для генотипирования не применяют референтный интервал в привычном для биохимических показателей понимании
Для этой панели исследуются три варианта NOD2 и один вариант ATG16L1. В бланке результата приведена клиническая интерпретация каждого варианта. Указание гетерозиготного или гомозиготного состояния возможно, если это предусмотрено форматом результата валидированного метода.Диагноз болезни Крона устанавливают из комплексной оценки клинических проявлений и результатов обследований. В зависимости от клинической ситуации диагностический алгоритм может включать:
1.Лабораторные исследования: общий анализ крови, С-реактивный белок, альбумин и другие показатели по клиническим показаниям;
2.Исследование кала, на фекальный кальпротектин лактоферрин, а также ПЦР обследование для исключения кишечных инфекций, инвазий;
3.Илеоколоноскопию с биопсией и гистологическим исследованием;
4. Визуализацию тонкой кишки - МР-энтерографию, КТ-энтерографию или кишечное ультразвуковое исследование в зависимости от доступности и клинической потребности.
Генетическое исследование NOD2 + ATG16L1 не заменяет указанные методы и не относится к основным диагностическим критериям болезни Крона. Не следует использовать результат как самостоятельное основание для назначения, изменения или отмены терапии.Ограничение клинического применения:
• выявление одного или нескольких вариантов не подтверждает диагноз болезни Крона;
• отсутствие исследуемых вариантов не исключает заболевания или других генетических факторов предрасположенности;
• результат не определяет индивидуальную вероятность развития болезни, ее активность, локализацию, тяжесть или риск осложнений;
• исследование не является основанием для назначения, изменения или отмены лечения;
• Клиническая значимость вариантов зависит от генетического и популяционного контекста.
